Серия Lego Minecraft является продуктом совместной работы Lego Group и компании CUUSOO, являющейся официальным партнёром из Японии. О начале сотрудничества было объявлено в 2008 году, но основная мировая схема работы была запущена лишь в 2011 году. Первоначально это был исключительно японский проект. Каждый желающий мог предложить свою самоделку и выставить её на общее голосование. Тот, кто набирал 1000 положительных отзывов, мог рассчитывать на реализацию своей идеи и оформления её в стоковый набор. Спустя некоторое время выяснилось, что практически в каждом коллекционере Лего можно увидеть профессионального дизайнера и конструктора. Кроме того, о компании CUUSOO стало известно практически во всех странах мира.
Проекту пришлось шагнуть далеко за пределы родной Японии. В 2011 году было объявлено, что, начиная с октября, любой желающий сможет загрузить свои творения на официальный сайт CUUSOO, и принять участие в голосовании. Из-за огромного количества поступивших проектов, проходной балл в размере 1000 голосов пришлось поднять до 10 000. Преодолев отборочный тур, и получив одобрительные голоса, самоделка отправляется на рассмотрение особому комитету Lego Group. Лишь избранным посчастливится стать реальными наборами и занять своё место на полках магазинов. Единственным ограничением для участников конкурса является возраст. На момент отправки работы молодому дизайнеру должно быть не менее 18 лет.
Первым набором, набравшим 1000 голосов, стала подводная лодка Лего 21100 Шинкай 6500. Модель была выпущена ограниченной серией в количестве 10000 экземпляров и продавалась только на территории Японии. Вторым совместным проектом стал набор Лего 21101 Хаябуса, также набравший необходимое число голосов. Хаябуса – это космический аппарат Японского агентства аэрокосмических исследований, предназначенный для изучения астероидов. Так как тематика покорения космоса очень близка поклонникам конструкторов Лего, набор получил широкую известность и поступил в продажу сразу в 23 странах мира.
Третьей темой совместной работы компании Lego и CUUSOO стало создание целой серии наборов, основанных на популярной компьютерной игре Minecraft. Эта игра была разработана шведским программистом Маркусом Перссоном. Она долго тестировалась, поэтому её официальный релиз состоялся лишь в ноябре 2011 года. Но, спустя короткое время, игра смогла заинтересовать тысячи геймеров и стать весьма популярной. По стилю, мир Minecraft полностью состоит из блоков. Это касается не только ландшафта и предметов, но и персонажей. Большинство сооружений в мире Лего также состоят из кирпичиков, блоков и секций, так что разработчикам было не сложно передать атмосферу микро мира, как верхних, так и нижних уровней.
Первый набор серии Лего Майнкрафт (Lego Minecraft) был выпущен в июне 2012 года. Изначально, он назывался Лего 21102 Майнкрафт микро мир, но затем, после подписания лицензионного соглашения между LEGO Group и независимой компанией-разработчиком Mojang, ему было присвоено место действия «Лес». Это было сделано для того, чтобы покупатели не путались в артикулах, так как в сентябре 2013 года поступили в продажу ещё два набора серии: Лего 21105 Майнкрафт микро мир: Деревня и Лего 21106 Майнкрафт микро мир: Нижний мир.
В 2014 году серия Майнкрафт пополнится сразу 7 новинками. Летом на прилавки магазинов поступит набор Лего 21107 Майнкрафт микро мир: Край, а в конце осени появятся 6 артикулов, посвящённых различным локациям игры.